知网查重没识别目录的原因可能是因为目录结构复杂，或者目录中包含特殊字符、空格等，这会导致查重系统无法识别目录内容。解决方法可以尝试调整目录结构，确保目录清晰简洁，避免特殊字符和空格，以提高查重准确性。

另外，知网查重系统有时会出现识别错误的情况，可能需要更新系统版本或联系知网客服进行技术支持。同时，也可以尝试将目录内容导出为txt文档再进行查重，避免系统识别问题。保持目录规范和清晰，有助于提高查重效果。