学术查重算上脚注的原因主要是为了确保学术论文的原创性和准确性。在学术界，引用他人的研究成果是非常普遍的，而脚注则是用来标注引用来源的地方。通过查重系统，可以检测论文中的文字是否存在抄袭，而算上脚注可以帮助系统更准确地判断引用的来源，避免误判。此举有助于维护学术诚信，促进学术交流。

另外，算上脚注也可以帮助作者更好地展示自己的研究深度和广度。在学术论文中，合理引用他人的研究成果不仅可以支撑作者的观点，还可以展示作者对相关领域的了解和研究基础。因此，学术查重算上脚注不仅是为了规范学术写作，更是为了提升学术水平和促进学术成果的传播与交流。